Το Τμήμα Μετεωρολογίας Κύπρου συμμετέχει ενεργά σε διεθνείς και περιφερειακές συνεργασίες, ενισχύοντας την επιστημονική έρευνα και τη διαχείριση μετεωρολογικών δεδομένων. Αποτελεί μέλος του Παγκόσμιου Μετεωρολογικού Οργανισμού (WMO) και του Δικτύου Εθνικών Μετεωρολογικών Υπηρεσιών της Ευρώπης (EIG EUMETNET), ενώ συμμετέχει στην πρωτοβουλία MEDARE (WMO) για τη διάσωση κλιματικών δεδομένων. Στο πλαίσιο συνεργασιών, το Τμήμα Μετεωρολογίας έχει υπογράψει:

• Τριμερές μνημόνιο συνεργασίας με την Εθνική Μετεωρολογική Υπηρεσία της Ελλάδας (ΕΜΥ) και τη Μετεωρολογική Υπηρεσία του Ισραήλ.
• Διμερές μνημόνιο συνεργασίας με τη Μετεωρολογική Υπηρεσία του Ισραήλ.

Το Τμήμα Μετεωρολογίας συνεργάζεται με ακαδημαϊκά ιδρύματα, όπως:

• Το Κυπριακό Ινστιτούτο (Cyprus Institute)
• Το Τεχνολογικό Πανεπιστήμιο Κύπρου (ΤΕΠΑΚ)
• Το Πανεπιστήμιο Φρέντερικ
• Το Ευρωπαϊκό Πανεπιστήμιο Κύπρου
• Το Πανεπιστήμιο Κύπρου

Επιπλέον, αποτελεί μέρος του Παγκόσμιου Συστήματος Πληροφοριών του WMO (WIS), ενώ εφαρμόζει το Σύστημα Διαχείρισης Ποιότητας ISO 9001:2015, διασφαλίζοντας υψηλά πρότυπα υπηρεσιών. Το Τμήμα Μετεωρολογίας έχει επίσης συνάψει μνημόνια συνεργασίας με φορείς, όπως:

• Τον Διαχειριστή Συστήματος Μεταφοράς Ενέργειας Κύπρου
• Την Αρχή Τηλεπικοινωνιών Κύπρου (Cyta)
• Το Κέντρο Συντονισμού Έρευνας και Διάσωσης
• Την Υδρομετεωρολογική Υπηρεσία της Σερβίας

Μέσω της συνεργασίας με την ΕΜΥ και τη Μετεωρολογική Υπηρεσία του Ισραήλ, το Τμήμα Μετεωρολογίας έχει αναπτύξει πλαίσιο διαδικασιών για τη διαχείριση της συνοπτικής μετεωρολογικής κατάστασης των έντονων καιρικών φαινομένων και την ονοματολογία συνοπτικών συστημάτων που σχετίζονται με σημαντικά καιρικά φαινόμενα στην Ανατολική Μεσόγειο. Τέλος, το Τμήμα Μετεωρολογίας έχει υπογράψει το στρατηγικό πλάνο των Εθνικών Μετεωρολογικών Υπηρεσιών της Ευρώπης, ενισχύοντας τη συνεργασία σε ευρωπαϊκό επίπεδο.